Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8A1P23610 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8A1P23610 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms