Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms