Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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