Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCMT1P22061 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCMT1P22061 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms