Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms