Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATF1P18846 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms