Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF30P17039 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF30P17039 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms