Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GNB3P16520 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms