Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFAP15692 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms