Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL2P13500 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL2P13500 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL2P13500 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms