Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI3P10071 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GLI3P10071 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI3P10071 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI3P10071 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms