Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms