Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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