Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-AP01891 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms