Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD2O96028 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms