Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms