Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALX3O95076 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALX3O95076 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALX3O95076 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALX3O95076 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms