Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN1O94985 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms