Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PITX3O75364 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PITX3O75364 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms