Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms