Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms