Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLIN1O60240 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms