Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms