Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms