Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLOCKO15516 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms