Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD7O15105 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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