Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNMO15061 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNMO15061 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms