Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9YO00507 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9YO00507 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9YO00507 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms