Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms