Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms