Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms