Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms