Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms