Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L4A6NCW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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