Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD2APQ9Y5K6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD2APQ9Y5K6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms