Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN16Q9Y5I7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN16Q9Y5I7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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