Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCQ9Y266 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms