Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms