Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms