Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms