Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms