Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKLN1Q9UL63 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms