Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms