Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms