Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH4Q9UIA0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms