Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms