Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5BQ9UGL1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms