Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms