Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms