Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GINM1Q9NU53 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINM1Q9NU53 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms